Tóm tắt Luận văn Thạc sĩ Khoa học: Nghiên cứu tạo cơ chất peptide đặc hiệu cho protease của HIV-1

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI<br /> TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN<br /> <br /> Trầ n Thi Thu Huyề n<br /> ̣<br /> <br /> NGHIÊN CỨU TẠO CƠ CHẤT PEPTIDE ĐẶC HIỆU<br /> CHO PROTEASE CỦA HIV-1<br /> <br /> LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC<br /> <br /> Hà Nội - 2016<br /> <br /> ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI<br /> TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN<br /> <br /> Trầ n Thi Thu Huyề n<br /> ̣<br /> <br /> NGHIÊN CỨU TẠO CƠ CHẤT PEPTIDE ĐẶC HIỆU<br /> CHO PROTEASE CỦA HIV-1<br /> <br /> Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm<br /> Mã số: 60420114<br /> <br /> LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC<br /> <br /> NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC: TS. Nguyễn Thị Hồng Loan<br /> GS.TS. Phan Tuấn Nghĩa<br /> <br /> Hà Nội – 2016<br /> <br /> LỜI CẢM ƠN<br /> Lời đầu tiên , tôi xin đƣợc bày tỏ lòng cảm ơn và kính trọng sâu sắc đối với<br /> GS.TS. Phan Tuấn Nghĩa và TS . Nguyễn Thị Hồng Loan đã tận tình hƣớng dẫn và<br /> tạo điều kiện thuận lợi nhấ t cho tôi trong suốt quá trình học tập , nghiên cứu và thực<br /> hiện luận văn này.<br /> Tôi cũng xin bày tỏ lòng biết ơn chân thành nhấ t đến các thầy giáo , cô giáo<br /> của Khoa Sinh học cũng nhƣ các thầy , cô thuộc Bộ môn Sinh lý Thực vật và Hóa<br /> sinh, Khoa Sinh học, Trƣờng Đại học Khoa học Tự nhiên đã truyền đạt cho tôi<br /> nhiều kiến thức nền tảng bổ ích.<br /> Lời cảm ơn tiếp theo tôi xin gửi tới các cán bộ, học viên sau đại học và sinh<br /> viên Phòng Protein tái tổ hợp, Phòng thí nghiệm trọng điểm Công nghệ Enzyme và<br /> Protein, Trƣờng Đại học Khoa học Tự nhiên đã chia sẻ và tạo những điều kiện tốt<br /> nhất để tôi học tập, nghiên cứu và hoàn thành luận văn này.<br /> Tôi xin gửi lời cảm ơn đến gia đinh và ba ̣n bè đã luôn dành tình cảm<br /> ̀<br /> <br /> , động<br /> <br /> viên và khích lệ tôi trong suố t quá trình ho ̣c tâ ̣p và hoàn thành luâ ̣n văn<br /> .<br /> Luận văn đƣợc thực hiện trong phạm vi nội dung và kinh phí của đề tài<br /> KLEPT-14-03.<br /> Hà Nội, 15 tháng 12 năm 2016<br /> Học viên,<br /> <br /> Trầ n Thi Thu Huyề n<br /> ̣<br /> <br /> MỤC LỤC<br /> Trang<br /> ̀<br /> ̉<br /> MƠ ĐÂU ............................................................................................................................... 1<br /> Chƣơng 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU .................................................................................... 2<br /> ́<br /> 1.1. GIƠI THIỆU CHUNG VỀ HIV VÀ PROTEASE CỦ A HIV-1 ................................ 3<br /> 1.1.1. HIV-1 nguyên nhân của bệnh AIDS .................................................................. 3<br /> 1.1.2. Cấ u trúc và chƣ́c năng của protease HIV-1 ....................................................... 3<br /> 1.2. CÁC PHƢƠNG PHÁP XÁC ĐỊNH HOẠT ĐỘ CỦA PROTEASE HIV ................. 7<br /> -1<br /> 1.2.1. Phƣơng pháp quang phổ kế ................................................................................ 7<br /> 1.2.2. Phƣơng pháp sắc ký lỏng cao áp pha đảo .......................................................... 9<br /> 1.2.3. Phƣơng pháp miễn dich ELISA ....................................................................... 10<br /> ̣<br /> 1.2.4. Phƣơng pháp xác đinh hoa ̣t đô ̣ của protease không đánh dấ u theo thời gian<br /> ̣<br /> (real time label free) bằ ng phân tich nanopore ........................................................... 10<br /> ́<br /> 1.3. ĐẶC TÍNH CƠ CHẤT PEPTIDE CỦA PROTEASE HIV-1 ................................. 11<br /> 1.3.1. Trình tự amino acid trong cơ chất của protease HIV-1.................................... 11<br /> 1.3.2. Các nghiên cứu về cơ chất đă ̣c hiê ̣u của protease HIV-1................................. 15<br /> 1.4. CÁC CHẤT ỨC CHẾ PROTEASE HIV -1 VÀ ỨNG DỤNG TRONG ĐIỀU TRỊ<br /> HIV/AIDS .................................................................................................................. 18<br /> 1.4.1. Các chấ t ƣ́c chế protease HIV-1....................................................................... 18<br /> 1.4.2. Ứng dụng chất ức chế protease HIV-1 trong điề u tri ̣HIV/AIDS .................... 20<br /> ́<br /> ́<br /> Chƣơng 2. NGUYÊN LIỆU VÀ PHƢƠNG PHAP NGHIÊN CƢU ................................... 23<br /> 2.1. NGUYÊN LIỆU ....................................................................................................... 23<br /> 2.2. MÁY MÓC VÀ TRANG THIẾT BỊ........................................................................ 23<br /> ́<br /> ́<br /> 2.3. PHƢƠNG PHAP NGHIÊN CƢU ............................................................................ 23<br /> 2.3.1. Xác định hoạt độ của protease HIV -1 sƣ̉ du ̣ng cơ chấ t peptide cải biế n trên<br /> máy quang phổ khả kiến ............................................................................................. 23<br /> 2.3.2. Xác định hoạt độ của protease HIV<br /> <br /> -1 bằ ng cơ chấ t huỳnh quang trên máy<br /> <br /> quang phổ kế huỳnh quang ......................................................................................... 25<br /> 2.3.3. Xác định các hằng số động học của protease HIV-1 ........................................ 26<br /> <br /> ̉<br /> Chƣơng 3. KẾT QUA VÀ THẢO LUẬN ........................................................................... 28<br /> ́<br /> 3.1. THIẾT KẾ TRÌNH TỰ AMINO ACID CỦA CƠ CHẤT PEPTIDE CHO XAC<br /> ĐINH HOA ̣T TÍNH PROTEASE HIV-1 ................................................................... 28<br /> ̣<br /> 3.1.1. Trình tự amino acid của cơ chất protease HIV-1 ............................................. 28<br /> 3.1.2. Xác định một số đặc tính của cơ chất Peptide CH<br /> ............................................. 29<br /> 3.1.3. So sánh ái lƣ̣c của protease với Peptide CH và mô ̣t số cơ chấ t khác ............... 34<br /> ́<br /> ̉<br /> ̉<br /> ́<br /> 3.2. THƢ NGHIỆM DÙ NG CƠ CHÂT PEPTIDE THIẾT KẾ TRONG PHAN ƢNG<br /> SÀNG LỌC CHẤT ỨC CHẾ CỦA PROTEASE HIV-1 ........................................... 37<br /> 3.2.1. Sàng lọc chất ức chế tiềm năng của protease HIV-1 ........................................ 37<br /> 3.2.2. Khả năng ức chế protease HIV-1 của acid 24(E)-3,4-seco-9βH-lanost4(28),7,24-trien-3,26-dioic ......................................................................................... 41<br /> 3.2.3. Xác đinh kiểu ức chế protease HIV -1 của acid 24(E)-3,4-seco-9βH-lanosta4(28),7,24-triene-3,26-dioic ....................................................................................... 42<br /> KẾT LUẬN .......................................................................................................................... 45<br /> KIẾN NGHI ......................................................................................................................... 46<br /> ̣<br /> TÀI LIỆU THAM KHẢO ................................................................................................... 47<br /> <br />