Luận án Tiến sĩ Vật lý: Động lực học cuốn protein trong môi trường tế bào

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO<br /> <br /> VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC<br /> VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM<br /> <br /> HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ<br /> ----------------------------<br /> <br /> BÙI PHƯƠNG THUÝ<br /> <br /> ĐỘNG LỰC HỌC CUỐN PROTEIN<br /> TRONG MÔI TRƯỜNG TẾ BÀO<br /> <br /> LUẬN ÁN TIẾN SĨ VẬT LÝ<br /> <br /> HÀ NỘI – 2016<br /> <br /> VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM<br /> HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ<br /> ……..….***…………<br /> <br /> BÙI PHƯƠNG THUÝ<br /> <br /> ĐỘNG LỰC HỌC CUỐN PROTEIN<br /> TRONG MÔI TRƯỜNG TẾ BÀO<br /> <br /> LUẬN ÁN TIẾN SĨ VẬT LÝ<br /> Chuyên ngành: Vật lý lý thuyết và vật lý toán<br /> Mã số: 62 44 01 03<br /> <br /> Người hướng dẫn khoa học:<br /> PGS. TS. Trịnh Xuân Hoàng<br /> <br /> Hà Nội – 2016<br /> <br /> LỜI CAM ĐOAN<br /> Tôi xin cam đoan luận án này là kết quả của quá trình làm nghiên cứu sinh của<br /> tôi trong thời gian học tập tại Viện Vật lý và Học viện Khoa học và Công nghệ. Cụ<br /> thể, chương một, chương hai và chương ba là phần tổng quan giới thiệu các vấn đề cơ<br /> sở có liên quan đến luận án. Chương bốn giới thiệu các phương pháp và thuật toán<br /> được tìm hiểu, xây dựng và phát triển trong luận án. Chương năm và chương sáu là<br /> các kết quả nghiên cứu mà tôi đã thực hiện cùng với thầy hướng dẫn. Chương bẩy là<br /> phần kết luận.<br /> Tôi xin khẳng định các kết quả có trong luận án “Động lực học cuốn protein trong<br /> môi trường tế bào” là các kết quả mới không trùng lặp với các kết quả của các luận án<br /> và công trình đã có.<br /> Tác giả luận án<br /> <br /> Bùi Phương Thuý<br /> <br /> 2<br /> <br /> LỜI CẢM ƠN<br /> Trước tiên em xin gửi lời cảm ơn chân thành tới Thầy - PGS. TS. Trịnh Xuân<br /> Hoàng đã giúp đỡ em hoàn thành luận án này. Trong suốt 10 năm học tập và nghiên<br /> cứu dưới sự hướng dẫn của Thầy, em đã được Thầy chỉ dẫn nhiều điều bổ ích về kiến<br /> thức, kỹ năng, tư duy nghiên cứu khoa học và sự nghiêm túc trong khoa học.<br /> Em cũng xin được gửi lời cảm ơn sâu sắc tới Thầy - GS. TSKH. Nguyễn Văn<br /> Liễn và các thầy giảng dạy, làm việc tại hai trung tâm Vật lý lý thuyết và Vật lý tính<br /> toán đã luôn tận tình động viên, hướng dẫn, cung cấp kiến thức nền tảng cho em. Các<br /> thầy là những tấm gương sáng về tinh thần làm việc, lối sống, sự say mê khoa học để<br /> em học hỏi, hoàn thiện bản thân. Cùng với kiến thức, đây sẽ là hành trang theo em<br /> suốt cuộc đời.<br /> Em xin cảm ơn Trường Đại học Sư phạm Kỹ thuật Nam Định, Trung tâm Vật<br /> lý tính toán, Bộ phận Đào tạo sau đại học thuộc Viện Vật lý và Học viện Khoa học và<br /> Công nghệ đã hỗ trợ, tạo điều kiện thuận lợi nhất cho em trong học tập, nghiên cứu<br /> và hoàn thành các thủ tục hành chính trong suốt quá trình làm NCS tại Viện Vật lý.<br /> Em xin cảm ơn các bạn cùng nhóm nghiên cứu, các bạn, các anh chị làm việc<br /> tại Viện Vật lý và các đồng nghiệp đã động viên, giúp đỡ em trong học tập cũng như<br /> trong cuộc sống.<br /> Hơn cả những gì có thể nói, con thực sự rất biết ơn gia đình đã luôn ở bên, yêu<br /> thương, động viên con, hỗ trợ về mọi mặt để con có thể yên tâm nghiên cứu và hoàn<br /> thành luận án này.<br /> Hà Nội, Tháng 4 năm 2016<br /> Bùi Phương Thuý<br /> <br /> Mục lục<br /> <br /> Danh sách hình vẽ<br /> <br /> 6<br /> <br /> Mở đầu<br /> <br /> 14<br /> <br /> 1 Thành phần hoá học và cấu trúc của protein<br /> <br /> 21<br /> <br /> 1.1. Thành phần hoá học của protein . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 21<br /> <br /> 1.2. Các bậc cấu trúc của protein . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 23<br /> <br /> 1.2.1. Cấu trúc bậc một . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 23<br /> <br /> 1.2.2. Cấu trúc bậc hai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 23<br /> <br /> 1.2.3. Cấu trúc bậc ba . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 25<br /> <br /> 1.2.4. Cấu trúc bậc bốn . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 25<br /> <br /> 1.3. Sinh tổng hợp của protein . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 26<br /> <br /> 1.3.1. Quá trình phiên mã . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 26<br /> <br /> 1.3.2. Quá trình dịch mã . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 26<br /> <br /> 1.4. Các tương tác của protein . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 27<br /> <br /> 1.5. Kết luận . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 29<br /> <br /> 2 Hiện tượng cuốn protein trong ống nghiệm<br /> <br /> 30<br /> <br /> 2.1. Hiện tượng cuốn protein trong ống nghiệm . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 31<br /> <br /> 2.2. Địa hình năng lượng của protein . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 33<br /> <br /> 2.2.1. Giả thiết về phễu cuốn . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .<br /> <br /> 33<br /> <br /> 3<br /> <br />