Trình tự genome

Bài viết trình bày xây dựng quy trình giải trình tự toàn bộ hệ gen (Whole Genome Sequencing) một số gen liên quan đến tính kháng thuốc của Plasmodium falciparum. Đối tượng và phương pháp nghiên cứu: Tối ưu hóa quy trình tách chiết ADN, chuẩn hóa nồng độ và số lượng ADN đầu vào, thiết kế 2 sét mồi đặc hiệu để khuếch đại các đoạn gen có liên quan đến 14 gen kháng thuốc điều trịsốt rét và tối ưu hóa các bước thực hiện giải trình tự toàn bộ hệ gen trên máy Miseq của hãng Illumina.

9p viperth 28-11-2024 1 1   Download

Trên phân tử DNA có thể xuất hiện nhiều biến đổi do sai hỏng trong quá trình trao đổi chất, do các tác nhân gây đột biến vật lý và hóa học của môi trường. Tuy nhiên, genome luôn có độ ổn định cao nhờ các cơ chế sửa chữa và bảo vệ DNA. DNA là phân tử duy nhất, mà khi biến đổi hay bị phá hỏng vẫn có khả năng được sửa chữa nhờ tế bào. Các cơ chế sửa sai rất đa dạng và có hiệu quả cao. Ba quá trình bao gồm sửa sai, tái bản...

21p kata_7 29-02-2012 573 86   Download

Là những đoạn trình tự ADN được lặp đi lặp lại và không tham gia làm nhiệm vụ mã hóa thông tin di truyền. AND không ghi mã lặp lại kế tiếp thường xuất hiện thành một khối các đoạn lặp lại liên tiếp nhau, ỗi khối có thể xuất hiện ở một vài hoặc nhiều vị trí trên các NST khác nhau. Đoạn trình tự lặp lại một lần có thể cấu tạo tới vài phần tẳm của genome, dài tới 5 Mb...

37p gasvtn 28-11-2009 261 90   Download

1970, thí nghiệm nghiên cứu đã thực hiện với các tế bào ung thư biểu bì phôi và các tế bào ung thư quái thai để tạo nên chuột thể khảm (Brinster 1974, Mintz và Illmensee 1975, Bradley 1984) Một kiểu chuyển genome khác ở động vật là chuyển nhân nguyên từ một phôi vào tế bào trứng chưa thụ tinh của một dòng nhận khác một cách trực tiếp (Mc Grath và Solter 1983)

49p tulip_12 14-01-2013 118 16   Download

1.1. Khái quát chung về cơ sở dữ liệu sinh học Cơ sở dữ liệu sinh học (CSDL) trong chương này chủ yếu đề cập đến các thông tin về trình tự Axit nucleic (ADN, ARN), trình tự axit amin của các phân tử Protein, thông tin về cấu trúc và giải phẫu của một số Genom, mô hình cấu trúc không gian của các đại phân tử.

39p anhphuonggl 11-04-2013 153 22   Download

Bài giảng Công nghệ Sinh học - Chương 2: Công nghệ gen và các ngành học omics trình bày các phương pháp nghiên cứu SHPT/CN Gen, genomics, proteomics, omics, chỉ thị phân tử - MAS, microarray - DNA/Protein chip. Hy vọng đây là tài liệu tham khảo hữu ích cho bạn.

99p conchimnon32 26-06-2014 210 45   Download

Đồ án tốt nghiệp này được thực hiện với mục tiêu nhằm ly trích và thu nhận DNA genomic từ mẫu vi khuẩn đã phân lập trong quá trình trồng ủ rơm; xác định nhóm vi khuẩn bằng phương pháp PCR của đoạn gene 16S rNDA dựa trên cặp mồi 27F và 1492R. Trình tự cặp mồi 27F 5‘-GA GTT TGA TCM TGG CTC AG-3‘, 1492R 5'-GG CTA CCT TGT TAC GAC TT-3'... Mời các bạn cùng tham khảo.

95p zhangyan 13-07-2021 39 6   Download

Bài thuyết trình: Từ gen đến sinh vật chuyển gen trình bày thành phần của genome, cấu trúc của gen, số gen trong genome, mô tả genome hệ thống, chọn lọc bằng phương pháp truyền thống, đột biến thực nghiệm trong genome.

42p thuyancn 25-06-2015 80 13   Download

Các loài cây mô hình như lúa (Oryza sativa L.) hoặc Arabidopsis thaliana có đặc điểm di truyền giúp người ta dễ dàng hiểu được các loài khác. Việc sử dụng cây mô hình tiết kiệm thời gian, tiền bạc khi so sánh các dữ liệu thông tin di truyền giữa các loài mà chúng ta muốn nghiên cứu. Mời bạn đọc cùng tham khảo báo cáo: Trình tự genome của cây mô hình và cải tiến giống cây trồng ở Việt Nam để tìm hiểu thêm về vấn đề nêu trên.

12p iasvn_org123 27-06-2014 112 12   Download

Giới thiệu về ADN satellite. Ở Eukaryote nói chung, và ở loài người nói riêng, trong genomes thì chỉ có chừng 5% là các trình tự mã hóa cho protein hoặc ARN (được gọi là gen). Số còn lại là các trình tự không mã hóa, trong số này trình tự ADN lặp lại liên tiếp chiếm một vị trí quan trọng, chúng được gọi là Tandem Repeat Sequence.

11p meomay_12 26-12-2013 121 11   Download

Ngân hàng bộ gen của một sinh vật là tập hợp các trình tự DNA cấu thành bộ gen được gắn vào vector, nó chỉ biểu diễn tổng số của gen. Ngân hàng này được tạo ra từ một bộ sưu tập DNA tái tổ hợp cả các chuỗi mã hóa lẫn các chuỗi không mã hóa. Khác với ngân hàng cDNA, ngân hàng bộ gen có thể được thiết lập bất kỳ loại tế bào nào của sinh vật nghiên cứu.

7p butmaulam 23-09-2013 234 10   Download

Giới thiệu Mô hình dữ liệu NCBI (tuần 1) Cơ sở dữ liệu trình tự GenBank (tuần 2) Cơ sở dữ liệu về cấu trúc (tuần 3) Cơ sở dữ liệu bản đồ genom (tuần 4) - Các cơ sở dữ liệu Cơ sở dữ liệu NCBI (National Center for Biotechnology Information) Cơ sở dữ liệu EMBL-EBI (European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute) Cơ sở dữ liệu CIB-DDBJ (Center for Information Biology-DNA Data Bank of Japan)

6p trautuongquan 25-02-2013 228 44   Download

1. Sau khi tìm hiểu các trang web ở trên hãy giải thích thế nào là genome browser ? 2. Mục đích của genome browser ? 3. Cho biết có bao nhiêu genome đã được xác định trình tự ở các genome browser ? 4. Sử dụng UCSC genome browser, hãy cho biết ý nghĩa của : BLAT Gene Sorter Insilico PCR Micribial genomes

6p lovewinter88 11-11-2012 201 20   Download

Sự phát triển của công nghệ giải mã trình tự đã giúp giải mã ngày càng nhiều các hệ gen, đặc biệt là những hệ gen có kích thước vừa và nhỏ như vi rút hay vi khuẩn (hơn 7000 bộ gen của vi rút và vi khuẩn đã được giải mã). Bên cạnh đó hệ gen của những sinh vật bậc cao cũng đã được giải mã hoàn chỉnh như người, chó, chuột. Điều đó dẫn đến một nhu cầu cấp thiết là phải nghiên cứu các phương pháp và xây dựng một chương trình so sánh và bắt...

42p chieu_mua 28-08-2012 81 11   Download

Lúa gạo là nguồn lƣơng thực giàu chất dinh dƣỡng chủ yếu trên thế giới, đứng thứ ba sau ngô và lúa mì về sản lƣợng, cung cấp trên 20% calo, 15% protein, các chất khoáng và chất xơ cho con ngƣời. Năm 2009, Việt Nam dự kiến sẽ tiếp tục đứng thứ hai thế giới về xuất khẩu gạo (khoảng 5,3 triệu tấn/năm) và tổng sản lƣợng đạt khoảng 36 triệu tấn/năm [62]. Khoảng 52% diện tích lúa đƣợc trồng ở ĐBSCL. Khi đánh giá về những thành tựu đạt đƣợc trong sự nghiệp đổi mới kinh tế ở Việt Nam, các nhà kinh tế...

58p carol123 20-07-2012 112 16   Download

HIV là virut có cấu trúc RNA, lây truyền từ người nhiễm sang người khác qua 3 con đường: đường máu, đường tình dục và lây truyền từ mẹ HIV(+) sang con. HIV tồn tại suốt đời trong cơ thể người nhiễm dù người đó có hay không được điều trị bằng thuốc kháng virut (ARV). Sở dĩ như vậy là vì trong chu kỳ nhân lên của virut trong các tế bào cơ thể người nhiễm, RNA của virut có khả năng sao chép ngược thành DNA, sau đó đoạn DNA tích hợp vào genom của tế bào cơ...

4p nkt_bibo32 07-01-2012 104 8   Download

Từ bệnh phẩm là mô sinh thiết của 3 bệnh nhân (BN) được chẩn đoán ung thư vòm họng (UTVH), phát hiện hệ gen EBV bằng phản ứng PCR. Sử dụng kỹ thuật dòng hóa và giải trình tự, toàn bộ chuỗi ARN thông tin đoạn gen LMP-1 của EBV được xác định trong cả 3 mẫu bệnh phẩm nghiên cứu. Detect Epsstein-Barr virus in patients with nasopharyngeal carcinoma by polymerase chain reaction Summary Genomic DNA from biopsy tissue of 3 patients with nasopharyngeal carcinoma (NPC) was extracted. Using PCR, cloning and sequencing, the entire mRNA of the LMP-1 gene of EBV was...

5p bupbelen_238 09-09-2011 178 19   Download

Kí sinh trùng sốt rét Plasmodium falciparum sử dụng nhiều con đường khác nhau để xâm nhập vào tế bào máu, tránh khỏi hệ thống miễn dịch của cơ thể và làm phức tạp cho việc tạo vaccine chống lại bệnh này. Một nhóm nghiên cứu đứng đầu bởi Alan F. Cowman, một nhà nghiên cứu quốc tế người Úc cùng với Howard Hughes Medical Institute, đã xác định một gene kí sinh trùng thường dùng để bật qua lại giữa những con đường xâm nhiễm. Những nhà nghiên cứu từ Scripps Research Institute (La Jolla, California) và Genomics...

4p thiuyen6 24-08-2011 76 7   Download

Thư viện bộ gene của một sv là tập hợp tất cả các trình tự DNA cấu thành bộ gene được gắn vào vector, sau đó được đưa vào tế bào chủ. Các tế bào chủ được nuôi cấy trên môi trường tạo dòng. Thư viện cDNA là tập hợp tất cả các bản sao từ mRNA của một tế bào, trong một điều kiện sinh lí nhất định, tại một thời điểm nhất định.

19p chuotk0n 26-06-2011 328 65   Download

Acid nucleic của virus 2.5.1 Các loại genom của virus Như trên đã nói, genom của virus rất đa dạng về cấu trúc, kích thước và thành phần nucleotid. Chúng có thể là ADN hoặc ARN, chuỗi đơn hoặc kép, thẳng hoặc khép vòng. Kích thước genom có thể từ 3500 nucleotid (ở phage nhỏ) đến 560.000 nucleotid (ở virus herpes). Các trình tự genom virus phải được đọc mã bởi tế bào chủ, cho nên các tín hiệu điều khiển phải được các yếu tố của tế bào chủ nhận biết. Các yếu tố này thường liên kết với...

9p cachuadam 26-05-2011 177 18   Download