Vi sinh ứng dụng (Applied Microbiology) là môn học nghiên cứu cơ chế sống, chuyển hóa và vai trò của vi sinh vật trong tự nhiên, đồng thời khai thác ứng dụng trong sản xuất thực phẩm, dược phẩm, môi trường và công nghệ sinh học. Đây là môn học cầu nối giữa kiến thức vi sinh cơ bản và các ứng dụng thực tiễn trong nhiều lĩnh vực công nghiệp và đời sống.